作为临时公共卫生设施的移动厕所，其实际使用时存在着多种问题。
首先，对于环境的危害问题。移动厕所通常没有专门的处理污水设施，处理方式不当会造成对周边环境的污染和危害，给当地居民带来生活麻烦。同时，有些移动厕所未采用消毒材料，对健康无疑有不利危害。有些移动厕所的建设和维护不足，存在卫生死角，无法彻底清洁，容易滋生细菌和病毒，其中还隐藏着不安全性。
其次，关于使用的问题。移动厕所地面不干净，细菌繁殖过度，地面处于状况较差，让人难以下脚，而且容易滑倒。在一些地区，由于用户的数量大，排队时间长，等候时间长，加上热天里的夏季气候，用户们在闻到臭味后，会有一定害怕和侮辱感，影响用户使用心情，难以有一良好的使用体验。
还存在针对特定人群的问题，比如儿童、老年人、残疾人等，使用时往往存在难度。比如，固定式坐厕高度不适合老年人和残疾人，吸力也不够强，容易分泌臭气；同时对于孩子来说，即使是坐便式的移动厕所，孩子在使用时也需要有家长的协助。此外，在夜晚使用移动厕所的时候由于移动厕所周围缺乏安全照明设施，存在着安全隐患。
其次，维护保养问题。由于移动厕所用于公共场合，经常使用，不仅使用数量较大，而且维修、保养等费用也很高，如果维修及时，可能会引发更多问题。此外，对于一些缺乏维护的移动厕所，容易存在设施老化、漏水、堵塞等问题，客观上增加使用者的不适体验和安全隐患。
在设计和规划阶段，城市官员和规划者需要充分考虑使用者的特殊需求，充分考虑安全部分，发挥好移动厕所的完备和功能的协调作用；此外，由于时间限制，需要采用简单易懂的清洗设备，以快速方便地进行清洁和维修。
铺设移动厕所，需要为设施的开发设计具备良好的基础设施，并做好维护。此外，控制使用数量，减少不必要的压力，防止厕所不足，也有利于降低它的使用状况，有效减少肮脏、臭味、排泄质量不佳等问题，体现出其真正作为便利性生活设施的本质。
